A FileZilla használata nagyon egyszerű, nem kell hozzá sok magyarázat. Csak meg kell adni az ftp kiszolgáló vagy a web kiszolgáló (ha az egyben ftp kiszolgáló is) címét, az ftp felhasználónevet és jelszót.
 
 
Viszont van néhány további beállítás, ami hasznos az ftp kapcsolat alatt. Ezek a teljesség igénye nélkül néhány képben alább látható.